近年来，淮阴区委、区政府积极贯彻落实《农民专业合作社法》，牢牢抓住改革创新理念，积极探索具有“淮阴特色”的农村经济发展模式，将农民专业合作社作为实施乡村振兴战略，提高农业供给质量的实践抓手，加大政策引导和资金扶持力度，培育了一批农民专业合作社，创建了一批农业品牌，促进了农业产业化经营的协调健康稳定发展。截止2017年底，全区各类农民专业合作社已发展到2100家，涉及种植、养殖、加工及服务等众多领域，其中：种植业1047家、养殖业300家、服务业370家、其它383家。全区农民专业合作社入社农户19.44万户，占全区农户的68.74%。
一、培育新型经营主体，提高土地规模效益。随着工业化、城镇化建设加快，农村青壮年劳力短缺，新生代农民不愿回乡务农，“谁来种地”成为现实问题。针对这些情况，淮阴区委、区政府在落实土地承包经营权不变和充分尊重农民意愿的提前下，于2014年出台了《关于发展村级土地耕作服务社，推进农业适度规模经营的试行意见》，引导土地向合作社、家庭农场、种植大户集中，让更少的农民种更多的地，找到了破解发展难题的答案。截止2017年底，全区经工商注册的村级土地耕作服务社已发展到204家，流转土地9.1万亩，占全区农户承包地的10.5%。淮阴区这一创新做法受到省市主要领导的充分肯定，并于2015年荣获“江苏省农业农村改革创新成果奖”。新华网、中国县域经济网、中国农业网、中国农民合作社研究网等主流媒体网站均先后报道了该区农村土地耕作服务社试点工作。
二、实施特色农产品品牌战略，提高农产品品质。淮阴区牢固树立“品牌就是竞争力、品牌就是生命力，有品牌才有市场、有市场才有效益”的发展理念，把加快特色农产品品牌创建，作为推进农业供给侧结构性改革，转变农业发展方式，提高农业综合生产能力的重要举措，积极推进农民专业合作社参与特色农产品品牌创建活动。一是建立政府主导、部门和协会参与的工作机制。由区政府牵头，农委、市场监管局、产业协会等共同参与，加强对全区农产品品牌建设管理，以地理标志证明商标为抓手，扩大地域特色农产品的度和影响力。二是打造淮阴农产品地理标志品牌。目前已成功注册了“淮阴黑猪”、“淮阴黄瓜”等22件农产品地理标志商标。三是开展农产品产业集群品牌培育基地建设。以现有的优势特色农产品及加工企业为基础，引导农民专业合作社建立起生产、流通各环节的经济合作，促进“企业+合作组织+基地+农户”生产经营模式，建成一批稳定、优质、标准、统一的农产品基地，推进农业标准化、规模化、基地化、品牌化生产。在历年的全省农民专业合作社产品展销会上，淮阴区历次荣获组织奖。参展的合作社的许多农产品获得“畅销农产品奖”、“江苏省十家电商农民合作社十家网络畅销产品品牌”、“江苏省十家农民合作社十家畅销产品品牌”等多种称号。目前全区农民专业合作社拥有注册商标220个，无公害农产品品牌71个，绿色农产品19个，有机农产品2个。
三、加强规范管理和加大扶持力度，加快合作社发展壮大进程。一是深入开展“五好”示范社创建活动。严格按照国家、省、市、区四级示范社创建标准，重点在健全规章制度、完善运行机制、规范利益分配、增强服务功能、提高市场竞争力方面下功夫，着力打造一批产权明晰、章程具体可行、财务管理规范、收益分配合理、运行机制良好的示范社。截止2017年底，全区共创成示范社3家，省级示范社19家，市级示范社101家。二是创新土地耕作服务社财务管理制度，明确收益分配办法，合作社规范运行。我区土地耕作服务社占全区农民专业合作社的9.7%，同质性比较高，抓住土地耕作服务社财务管理就抓住了全区农民专业合作社财务管理的“牛鼻子”，以此为重点，向面上推广。制度规定：服务社经营收入先行缴付每亩30元至60元给村集体作为服务费用，之后按照服务社章程载明的盈利分配方案，提取60%盈余公积，其中40%作为村集体经济组织收入，20%作为公积金用于服务社再投入，余下的40%对服务社理事成员进行盈余分红。服务社财务由乡镇统一管理，资金使用实行报账制，农工部委托第三方机构为服务社代账。农工部、财政局、审计局等部门定期对服务社财务运行情况进行会审，确保资金、资产使用合理，防止流失。三是加大资金扶持力度，促进合作社做大做强。按照“动态管理、有进有退、从严把关”的原则，规范编制年度政府优先扶持合作社发展名录。自2015年以来，全区共向上争取资金4202.8万元，实施合作社新型主体培育、综合社试点、合作社创新、农业产业化等项目45个，极大地提高了合作社的发展能力。