玉米腐穗病是玉米生长后期的重要病害之一，又称玉米穗粒腐病，属世界性病害。一般品种发病率为5%-10%，感病品种发病率可达50%左右，造成严重损失。玉米穗腐病不仅因果穗腐烂而导致直接减产，而且可使带菌的种子发芽率和幼苗成活率均降低，造成进一步的损失。此外，玉米穗腐病的部分病原菌产生大量真菌霉素，严重威胁人畜的生命健康。
从果穗顶端或基部开始发病，大片或整个果穗腐烂，病粒皱缩、无光泽、不饱满，有时子粒间有粉红色或灰白色菌丝体产生，其上密生红色粉状物，病粒易破碎。果穗病部苞叶长被密集的菌丝贯穿，粘贴在一起贴在果穗上不易剥离。
⑴玉米丝核菌穗腐病：早期在果穗上长出橙红色霉层，后期病果穗变为暗灰色，在外苞叶上生出白色至橙红色或暗褐色至黑色小菌核。
⑵玉米青霉穗腐病：该病主要发生在机械损伤、害虫或鸟等危害的果穗上，在子粒或子粒间产生青绿色或绿褐色霉状物，多发生在穗的。病原菌侵入种胚的，种子发芽时引起幼苗萎凋。
⑶玉米粉红聚端孢穗腐病：果穗全部或部分生出浅红色霉状物，使子粒发霉，多发生在收获后的果穗上，遇有秋雨连绵的年份也可发生在田间。
⑷玉米小斑病T小种穗腐病：病部生不规则的灰黑色霉区，引起穗腐，严重的果穗腐烂，种子发黑霉变，还可侵染叶片、叶鞘及苞叶，病斑较大。
⑸玉米色二孢穗腐病：发病早的果穗苞叶呈苍白色，在吐丝后1周内发病，果穗变为灰褐色，整个果穗萎缩或腐烂。果穗呈直立状态，果穗和内苞叶或内苞叶之间紧密黏附，菌丝在其间生长繁殖，后期苞叶上、花苞及子粒边缘产生黑色粉状物。植株生长后期果穗发病，外表症状不明显。侵染始于果穗基部，从果穗梗处向上扩展。剥开果穗或脱粒时，可发现子粒之间长有一层白色的霉菌，其顶部已变色。
⑹玉米灰葡萄孢穗腐病：主要危害雌穗。花丝发病病部呈现水渍状。果穗发病多发生在有机械伤或昆虫的穗上，子粒上或子粒间生灰色至灰绿色霉状物，常在穗的或上半部发生。
发病特点：
该病是由真菌引起的。
⑴玉米丝核菌穗腐病：病原菌为半知菌亚门真菌立枯丝核菌（Rhizoctonia solani），在种子、土壤或病残体上越冬。
⑵玉米青霉穗腐病：病原菌为半知菌亚门真菌草酸青霉（Penicillium oxalicum），腐生于各种有机肥上，通过各种伤口侵入危害，也可通过病健果穗接触传播。病原菌发育适温18-28°C，相对湿度95%-98%时有利于发病。
⑶玉米粉红聚端孢穗腐病：病原菌为半知菌亚门真菌粉红聚端孢（Trichothecium roseum），随病残体留在土壤中越冬，次年春天条件适宜时传播到果穗上，从伤口侵入。发病后病部产生的病原菌借风雨传播蔓延，进行再侵染。病原菌发育适温25-30°C，相对湿度高于85%易发病。
⑷玉米小斑病T小种穗腐病：病原菌为半知菌亚门真菌玉蜀黍平脐蠕孢T小种（Bipolaris maydis），在病残体上越冬，为初侵染源，病原菌借风雨、气流传播进行侵染和再侵染。产生孢子适温度23-25°C.遇充足水分或高湿条件，病情扩展迅速。玉米孕穗、抽穗期降水多、湿度高，容易造成小斑病的流行。低洼地、过于密植的隐蔽地、连作田发病较重。
⑸玉米色二孢穗腐病：病原菌为半知菌亚门真菌玉米色二孢（Diplodia zeae），在带病种子或秸秆上越冬，随风传播。玉米吐雄时叶鞘较松散，落入叶鞘里的病原菌直接或经伤口侵入，也可从茎秆基部、不定芽或花丝、穗梗的苞叶直接侵入。
⑹玉米灰葡萄孢穗腐病：病原菌为半知菌亚门真菌病玉米灰葡萄孢（Botrytis cinerea），随病残体在土壤中越冬，借气流传播蔓延，遇有适温及叶面有水滴条件，从伤口或衰弱的组织上侵入。病部产生大量分生孢子进行再侵染，后逐渐形成菌核越冬。
病害方法：
⑴农业防治：选用抗病品种；适当调节播种期，尽可能使玉米孕穗期不要于雨季相遇；发病后注意开沟排水，防止湿气滞留，可减轻受害程度尽量避免造成伤口，注意防止鸟害。玉米生长后期（7-8月份）正值雨季，高湿的田间小气候有利于穗粒腐病的扩展，在玉米大喇叭口期可结合药剂灌心拔除病株、可疑株。玉米吐丝授粉期至乳熟期继续拔除病株，扫残，并将病株深埋、烧毁，不要在田间随意丢放。在玉米生长后期实行人工苞叶晒子粒措施，能有效田间病情的扩展，注意不要扭果穗穗柄，以免影响子粒灌浆。湿度密植，不用病株喂牛，防止粪便带菌；清洁田园，处理田间病株残体等；同时秋季深翻土地，减少病菌来源；实行轮作，与高粱、谷子、大豆、甘薯、早稻等作物实行3年以上轮作；施用不带菌肥料，叫少土壤病菌。
⑵药剂防治：
①对玉米丝核菌穗腐病、玉米分红聚端孢穗腐病，向穗部喷药，常用药剂有5%井冈素水剂1000倍液，50%甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液，50%多菌灵悬浮剂700-800倍液，50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液，40%农利灵可湿性粉剂1000倍液。
②玉米青霉穗腐病：70%甲基硫菌灵超微可湿性粉剂1000倍液，50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液，40%多菌灵胶悬剂600倍液，50%甲基硫菌灵可湿性粉剂500-1000倍液，45%特克多悬浮剂3000-4000倍液，对青霉病防效显着。
③玉米小斑病T种穗拂病用75%百菌清可湿性粉剂800倍液，70%甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液，每隔7-10天用药1次，连防2-3次。